Les confessions non-chrétiennes
La plus grande tradition non-chrétienne en Estonie est l’islam. Les musulmans constituent 0,1 % de la population totale. La majorité des musulmans sont des Tatars qui sont arrivés en Estonie à la fin du 19e et au début du 20e siècle. Il existe deux associations religieuses musulmanes reconnues en Estonie.
La tradition religieuse autochtone (voir Kaasik Ahto, Old Estonian Religion. Estonian Culture 2, 2003) est représentée par la « Chambre des Taara et des religions autochtones ».
Quatre congrégations bouddhistes et trois associations de tradition autochtone, dont une juive et une association pour la conscience de Krishna, sont reconnues comme associations religieuses en Estonie.